商贷转公积金银行有可能会拒绝。因为在借贷人不满足条件的情况下，银行是不会同意转的，比如还款期间有逾期或征信不良以及未还清商贷本金等。通常商业贷款是由商业银行审批和放款的，公积金贷款是由住房公积金中心负责审批和放款的。虽然都是房贷，可是两个部门对借款人的要求不同，所以并不是说商贷能下来，商转公就能成功。
因为商转公的前提条件之一就是要征求原商贷银行的同意，但要是借款人没有达到要求，原商业银行是不会配合商转公的。主要有这几个方面的原因：
1、商转公必须先把在商业贷款剩余的本金额度结清，才能向住房公积金中心申请转贷。其中借款人可以自筹资金，或者是找担保公司先行垫付资金，然后等商转公成功后放款给担保公司。要是没有结清商贷剩余额度，原商业银行不会同意其商转公申请。
2、借款人存在严重失信行为，比如征信上有止付，或者是被纳入失信被执行人名单。还有就是当前贷款存在逾期或代偿的，征信有连续逾期6期的贷款或信用卡记录等，也是不符合商转公要求，银行也会拒绝借款人办理。
3、商转公贷款申请的额度超过原商业银行房贷剩余本金余额，则会因为额度不足被拒贷。借款人要么提高首付比例，把商转公额度降到不高于原商业银行房贷剩余本金余额再去转贷。
4、借款人用纯商业贷款购买的第三套房，去申请商转公也会被银行拒绝。因为公积金贷款最多只能购买二套房，买三套房显然是不合要求的。
5、借款人在商转公前，有为别人做公积金贷款担保人，在对方的公积金贷款还清前，自己是不能办理商转公的。
商业贷转公积金注意事项
1、商业贷转公积金需要获得原商业贷银行同意，然后要结清商业贷剩余本金额度，并且在结清后30天内提出申请。
2、商业贷转公积金需要用公积金中心认可的资产设定抵押，像商业贷房屋已出产权证的则要用本套房抵押，未出产权证的要用家庭名下另一套获得产权的房子来做抵押。
3、商业贷转公积金还得要满足公积金贷款的所有基本要求，比如公积金账户状态正常且缴存时间达标，借款人信用良好具备稳定的偿付能力，并且商转公额度不能超过原商贷剩余本金额度等等。
