喹诺酮类药主要用于鱼病防治的有萘啶酸、吡哌酸、环丙沙星等，这类药物对革兰氏阳性菌及阴性菌均有效，尤其对革兰氏阴性菌抗菌作用强，而鱼病的病原菌多属革兰氏阴性菌。该类药具有高效、低残留、毒副作用小等优点，是日前较抗生素、磺胺类和呋喃类抗菌药更具开发前景的鱼药。
萘啶酸为第一代喹诺酮类药物，主要对革兰氏阴性菌有效，如气单菌、假单胞菌、变形杆菌、伤寒杆菌、痢疾杆菌、大肠杆菌。口服易吸收，在鱼病治疗上主要用于赤皮病、肠炎病、疖疮病、弧菌病、烂鳃病等细菌性病。
内服：每100公斤鱼每天用药3~5克拌饵投喂，连喂6天；浸洗：以浓度药液浸洗鱼体lO-20分钟：遍洒，全池遍洒。
吡哌酸为第二代喹诺酮类药物，主要对革兰氏阴性菌有较好的抗菌作用，鱼病防治上主要用于治疗赤皮病、烂鳃病、肠炎病、白皮病、竖鳞病、疖疮病、打印病、弧菌病、细菌性败血症等。使用方法同萘啶酸。
氟哌酸又叫诺氟沙星，为第三代喹诺酮类药物，具有抗菌谱广、作用强的特点，抑菌浓度远较其他常用抗革兰氏阴性菌浓度低。口服吸收迅速，连续给药无蓄积作用。鱼病防治上己初见成效。主要用于赤皮病、烂鳃病、肠炎病、疖疮病、打印病、白皮病、弧菌病、竖鳞病、细菌性败血症、鳖红脖子病、鳖红底板病、鳖腐皮病、蛙红腿病。
口服：每100公斤鱼每天用药1-3克，拌饵连喂3-6天；浸洗：以浸洗鱼体10-20分钟；遍洒：全池遍洒。
环丙沙星也是第三代喹诺酮类抗菌药，具有更强更广的杀菌效果，相当于氟哌酸的2-4倍，但价格较高。
内服：每100公斤鱼每天用药0.8-1.5克，拌饵连喂3-6天：浸洗：以浓度浸洗IO-20分钟。
喹诺酮类药物内服时可配合外用优氯净、鱼安等有机氯消毒剂全池遍洒效果更佳，但对呋喃类药物、氯霉素、利福平等有拮抗作用而影响药效。对于这些抗菌药物应避免长期大量使用，以免产生抗药性。
