当前，我国农村养鱼场和养鱼户，主要是依靠肉眼检查鱼病。根据疾病表现的症状和肉眼所能看到的寄生虫进行诊断。采用这种诊断，要求检查的病鱼，必须是刚死或死后不久的鲜鱼，检查5。10尾，检查的部位主要集中在体表、鳃瓣和肠道。
(1)体表。将病鱼置于白搪瓷盘内，按顺序从头部、嘴、眼、鳃盖、鳞片和鳍条等处仔细观察。在体表可看到各种鱼病症状和大型寄生虫。如发现病鱼肌肉、鳃盖和鳍基充血发红，可诊断为病毒性出血病或暴发性鱼病：鳞片脱落、体表充血发炎，则为赤皮病，尾柄或腹部两侧腐烂成指印状的红斑，则为打印病；病变部位发白，向腹、胸部蔓延则为白皮病；头部和嘴唇周围色素消失，呈现白头白嘴，则为白头白嘴病。鱼体着生有棉絮状白色物，则为水霉病，部分鳞片、鳍条基部或下颌发炎红肿，红点部位有针状虫体，则为锚头鳋病，鱼体生有白点状胞囊，则为粘孢子虫病；肛门红肿，轻压腹部有血黄色黏液从肠道流出，则为肠炎病，体表、鳍条布满大小均匀的白色小点薄膜层，则为小瓜虫病，鱼体上发现有形似臭虫状的虫体则为鲺病，病鱼尾巴极度上翘、脑颅发黑，在水中狂游打圈，则为疯狂病。
(2)鳃瓣。用剪刀将鳃盖除去，观察鳃丝有否异常。若发现鳃丝腐烂，末端软骨外露，黏液较多或附有污泥，则为细菌性烂鳃病，鳃腐烂，末端软骨外露，黏液较多或附有污泥，则为细菌性烂鳃病，鳃呈粉红色或有时有点状充血，则为鳃霉病，鳃丝末端挂着似绳蛆一样的白色小虫为中华鱼蚤病；鳃丝苍白、多黏液，鳃盖张开，则为指环虫病；鳃丝上有白点或胞囊，则为粘孢子虫病。
(3)肠道。剪刀从舡门伸入，向前剪至胸鳍基部，然后再回肛门部位向左上方沿侧线剪至鳃盖后缘，向下剪至胸鳍基部，除去整片侧肌。先观察内脏有否腹水和大型寄生虫，如鱼怪、线虫、绦虫等，后用剪刀从靠咽喉部位的前肠和肛门的后肠剪断，取出整个内脏置于盘中，将肝、胆、脾、鳔等器官逐个分开，再剪开肠管，去掉肠内食物残渣和粪便，进行仔细观察，有时可发现吸虫、绦虫和线虫。若发现肠壁充血发炎，即为肠炎病，肠壁有稀散或成片的小白点，则为粘孢子虫病或球虫病。
