抗生素的滥用是一个世界性问题，但在我国更为严重。2013年的统计表明，我国抗生素年使用量达16.2万吨，约占世界总用量的一半，其中52%为兽用。在畜禽养殖业中，约85%以上抗生素药物未被代谢而是直接排贩柿环境中。据估算，我国每年畜禽粪便排泄物排放量高达45亿吨。将生命与食物品质科学、微生物制药工程、功能食品及生物资源工程作为研究方向的全国政协委员、中山大学食品与健康工程研究院院长刘昕，持续几年的提案均环绕抗生素污染而展开。今年全国两会上，“抗生素污染物”再次被刘昕关注。
刘昕强调，抗生素抗性基因对环境生态和人类健康危害被列为21世纪威胁人类健康的最重要挑战之一。抗生素抗性基因在环境中可持久性残留、迁移，并可通过基因水平转移在菌群间传播，诱导耐药菌株产生，对环境生态和人类健康的危害远大于抗生素残留。
近日，重旦大学一项关于抗生素的研究引起广泛关注。研究发明，婴幼儿时期抗生素的使用与儿童时期肥肥风险有关。研究人员从数千份儿童尿样中测定出21种抗生素，包括5种大环内酯类抗生素、2种β-内酰胺类抗生素、3种四环素类抗生素、4种喹诺酮类抗生素、4种磺胺类抗生素和3种氯霉素类抗生素，其中79.6%的学龄儿童尿液中检出一种或多种抗生素，而且在儿童尿液中还检测到金霉素、恩诺沙星等只限于禽畜使用的抗生素。
据估算，我国每年畜禽粪便排泄物排放量高达45亿吨，水产养殖业使用的抗生素仅有10%—20%被鱼类吸收，80%—90%陷入水环境中。
抗生素的大量使用，已引起耐药菌的大幅增长。临床抗生素滥用的严重后果是造成细菌对已有的抗生素产生交织耐药和多重耐药现象，使临床难治性、感染性疾病发生率显然上升，约摸导致临床对耐药菌束手无策。例如，天然青霉素在控制金黄色葡萄球菌感染方面几乎已失去药用价值，人群中感染的金黄色葡萄球菌接近80%产生了对青霉素G的耐药性;我国医院中分离到的大肠杆菌对氟喳诺酮的耐药率在50%—60%，而在欧洲及美国为5%以下。
据统计，我国兽药渔药抗生素用量约为美国的4倍，且大量使用的兽药渔药至今未制定药物残留指标。2014年第9期《科学通报》发表文章，报告了68种抗生素在我国地表水环境中被检出，其中一些抗生素在珠江、黄浦江等地的检出频率高达100%，有些抗生素检出的浓度高达每升几百纳克(工业发达国家水体中被检出浓度小于20纳克)。每天排放数量巨大的工业废水、城市生存污水、农村生存污水及水产养殖业的直接排放等，均可对地表水、地下水和农田土壤环境造成严重污染。迄今为止，已经有16种四环素类抗性基因、3种磺胺类抗性基因和10种β-内酰胺类抗性基因，在废水、河流、海洋、灌溉渠、养殖场水体、污水处理厂、饮用水、沉积物、土壤、空气等环境介质中被发明，表明这些污染物已经无处不在。被抗生素污染的水可通过各种途径陷入河流、地下水源，抗生素抗性基因可以通过多种途径如土壤、饮用水、粪便、微生物、动物、植物和人之间相互传递，可导致土壤成为硕大的耐药基因库，将对环境微生态造成严重的影响。
工业发达国家均采取严肃的手段限制抗生素的使用，城市中污水处理率几乎达到100%，处理后的污水未达到标准严禁排放入水环境中。目前，我国许多城市污水处理率不足70%，大量未经任何处理的污水直接排入江河。
