当水温在20℃以下时一般不建议使用芽孢杆菌，因为菌种在水温低的环境中生长缓慢，无法迅速形成优势种，使用效果不明显，建议在水温25℃以上时使用芽孢杆菌。在使用时需先将菌、红糖和水按照0.5：1.5：25的比例浸泡2个小时以上，然后选在晴天上午9点至11点使用。
一、水温20度以下能用芽孢杆菌吗
1、一般不建议在水温20℃以下时使用芽孢杆菌，因为水温低，会导致菌种生长缓慢，无法迅速形成优势种，使用效果不明显，建议在水温25℃以上时使用。芽孢杆菌是一种好氧或兼性厌氧呼吸，能产生抗逆性孢子的杆状有益菌，在水产中使用的有益芽孢杆菌主要是枯草芽孢杆菌。
2、在使用时先将菌、红糖以及水按照0.5：1.5：25的比例浸泡2个小时以上，在浸泡时可用小气泵曝气，因为枯草芽孢繁殖需要大量氧气，因此建议在晴天上午9点至11点使用，保证有充足的氧气。
3、不建议在阴天使用芽孢杆菌，因为芽孢杆菌进水活化后会消耗水中的氧气，若在阴天使用会造成缺氧，而且也不能将芽孢杆菌与抗菌药物或消毒剂一起使用。
二、芽孢杆菌在水产养殖中有什么作用
1、改良水质：芽孢杆菌具有分解有机物、氨氮、亚硝酸盐等能力，而且还能分解水中的粪便和残饵，因此对于改善水质和底质有良好的效果。
2、抑制致病菌：当芽孢杆菌在水体中占到优势后，会抑制有害菌的生长，当它进入水产物的肠道后能抑制病菌，并大量的耗氧，将肠道保持在一个厌氧的环境中，从而达到抑制病菌的作用。
3、增强水产动物的免疫力：定期使用芽孢杆菌，能保持水质菌相，抑制有害菌的生长，维持水质稳定，保证水产物能正常生长。
4、促进水产动物的生长：芽孢杆菌在水产动物的肠道中会产生维生素、氨基酸、有机酸等并参与动物的新陈代谢，从而促使它们尽快生长。
5、改善水产动物的肉质：芽孢杆菌能降低动物体内的水分，提高粗蛋白质含量，改善肉质和体色。
